Lekárska genetika a diagnostika 1/2025
Priestorová transkriptomika v onkologickej diagnostike
Priestorová transkriptomika (PT) je revolučná technológia, ktorá prepája analýzu génovej expresie na úrovni mRNA molekúl s ich priestorovým usporiadaním. Na rozdiel od samotných sekvenovacích metód, ktoré neposkytujú informácie o distribúcii transkriptov, PT umožňuje získať komplexnejší obraz o študovanom tkanive a jeho architektúre. Táto metóda je čoraz častejšie používaná v onkologickom výskume, v ktorom odhaľuje špecifické expresné profily bunkových populácií v nádorovom mikroprostredí, jeho heterogenitu a medzibunkové interakcie. Vďaka tomu poznatky získané pomocou PT poskytujú možnosti pre identifikáciu nových terapeutických cieľov a biomarkerov, výber vhodnej terapie a informácie o možnej rezistencii nádoru na terapiu.
Kľúčové slová: priestorová transkriptomika, metódy priestorovej transkriptomiky, profilovanie génovej expresie, nádorové mikroprostredie
Spatial transcriptomics in oncology diagnostics
Spatial transcriptomics (ST) is a revolutionary technology that integrates gene expression analysis at the mRNA level with its precise spatial localization within tissues. Unlike conventional sequencing methods, which lack spatial resolution, ST provides a more comprehensive understanding of tissue architecture and organization of cells. This approach is becoming increasingly studied in oncology research, where it enables the identification of expression profiles of cellular populations within the tumor microenvironment, characterizes tumor heterogeneity, and maps intercellular interactions. By offering spatially resolved molecular insights, ST holds significant potential for discovering novel therapeutic targets and biomarkers, guiding treatment selection, and predicting tumor resistance to therapy.
Keywords: spatial transcriptomics, methods of spatial transcriptomics, gene expression profiling, tumor microenvironment
